Le service Chromeleon Instrument Controller gère tous les processus en temps réel liés aux instruments (échanges, pilotage et acquisition de données). Il s’exécute en arrière-plan comme un service Windows sur les ordinateurs auxquels les instruments sont connectés physiquement. L’état de ce service est signalé au moyen d’une icône (
ou 
) dans la zone de notification de la barre des tâches de Windows.